Krynica Morska znajduje się na terenie Parku Krajobrazowego Mierzeja Wiślana położonego między Bałtykiem i Zalewem Wiślanym. Zachodnią część osady zajmuje rezerwat przyrody Buki Mierzei Wiślanej, a 16km na wschód od Krynicy obok miejscowości Piaski znajduje się teren Federacji Rosyjskiej, a dokładnie Obwodu Kaliningradzkiego. Równocześnie miejsce to jest także granicą Unii Europejskiej i NATO.